16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1955 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2655  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1955  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3042  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3008  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000223422  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2942  hypothetical protein  97.7 
 
 
87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1593  hypothetical protein  84.44 
 
 
90 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0525  hypothetical protein  62.65 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000746817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1004  hypothetical protein  62.65 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0964  hypothetical protein  62.65 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  normal  0.407699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4112  hypothetical protein  61.18 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000132695  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0876  hypothetical protein  55.68 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419749  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0864  hypothetical protein  55.68 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2394  hypothetical protein  57.83 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0675  hypothetical protein  46.77 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal  0.950621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3079  hypothetical protein  49.21 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0912  hypothetical protein  60 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>