39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0536 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3039  malonate transporter, L subunit  100 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0536  malonate transporter, MadL subunit  100 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.625704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1479  malonate transporter, MadL subunit  100 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0617  malonate transporter, MadL subunit  100 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1253  malonate transporter, MadL subunit  100 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1449  malonate transporter, MadL subunit  98.47 
 
 
131 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1579  malonate transporter, L subunit  98.47 
 
 
131 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2805  malonate transporter, L subunit  91.6 
 
 
205 aa  197  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1145  malonate transporter MadL subunit  80.15 
 
 
131 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1239  malonate transporter, MadL subunit  80.92 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.163591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0786  malonate transporter MadL subunit  80.92 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1267  malonate transporter MadL subunit  80.92 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2052  malonate transporter, MadL subunit  80.92 
 
 
131 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1157  malonate transporter, MadL subunit  80.15 
 
 
131 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775412  normal  0.145161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3868  malonate transporter, MadL subunit  70.45 
 
 
135 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4944  malonate transporter, MadL subunit  70.45 
 
 
135 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0481665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6323  malonate transporter, MadL subunit  76.15 
 
 
131 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2445  malonate transporter, MadL subunit  63.64 
 
 
140 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4410  malonate/sodium symporter MadL subunit  80.15 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5080  malonate transporter, MadL subunit  58.14 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5295  malonate transporter MadL subunit  59.52 
 
 
138 aa  143  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127273  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5376  malonate transporter, MadL subunit  73.2 
 
 
138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0540357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0449  malonate transporter MadL subunit  57.36 
 
 
138 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315298  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1611  malonate transporter MadL subunit  82.8 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3194  malonate transporter, MadL subunit  54.2 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3150  malonate transporter, MadL subunit  53.23 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0954  malonate transporter MadL subunit  51.91 
 
 
139 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10350  malonate transporter, MadL subunit  55.12 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.784463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6858  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 
148 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2876  malonate transporter, MadL subunit  54.24 
 
 
133 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452237  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4285  malonate transporter MadL subunit  50.82 
 
 
140 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0889928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0299  malonate transporter subunit MadL  58.97 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02630  putative malonate carrier protein  53.44 
 
 
134 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524132  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0045  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 
151 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0451668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1329  transporter  48.33 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1552  malonate transporter, MadL subunit  50 
 
 
131 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0430207  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1064  transporter  45.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3291  hypothetical protein  45.45 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1148  malonate/sodium symporter, MadL subunit  47.33 
 
 
134 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0497495  normal  0.756972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>