10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0053 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_t0053  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0197989  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1375  tRNA-Glu  94.52 
 
 
75 bp  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0011  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>