20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_tRNA48 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_tRNA48  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.719736  normal  0.23848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1247  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.207064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00178807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.457382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>