21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0059 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0059  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  258  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3641  hypothetical protein  88.46 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3428  hypothetical protein  83.85 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1605  putative exported protein of unknown function  77.98 
 
 		 131 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2739  hypothetical protein  79.81 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3129  hypothetical protein  54.95 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9867  hypothetical protein  55.86 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4219  hypothetical protein  52.29 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.860322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4593  hypothetical protein  53.57 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434724  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1852  hypothetical protein  48.74 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3974  hypothetical protein  52.99 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890346  normal  0.211994 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4357  hypothetical protein  48.78 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513388  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4831  hypothetical protein  54.9 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3811  hypothetical protein  53.64 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4110  hypothetical protein  51.82 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4659  hypothetical protein  46.67 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1101  hypothetical protein  48.08 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2565  hypothetical protein  45.19 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.339872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1021  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  42.11 
 
 		 518 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2253  hypothetical protein  30.63 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847078  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>