21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29940  Phosphoribosyltransferase protein  100 
 
 
321 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3456  phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
316 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.807464  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3244  hypothetical protein  38.76 
 
 
316 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3722  hypothetical protein  38.44 
 
 
316 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4545  phosphoribosyltransferase  38.7 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0996613  normal  0.214352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3246  hypothetical protein  37.02 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3720  hypothetical protein  35.82 
 
 
317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3454  hypothetical protein  35.82 
 
 
317 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0322  phosphoribosyltransferse  33.33 
 
 
272 aa  119  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.27724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.48 
 
 
162 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1773  hypothetical protein  35.25 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.532905  hitchhiker  0.00000140716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4897  phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0618745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3350  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  hitchhiker  0.000109825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
188 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
148 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
207 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1965  amidophosphoribosyltransferase  25.71 
 
 
504 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.960535  normal  0.602914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
192 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>