10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2298 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2298  gas vesicle protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03777  gas vesicle protein  34.35 
 
 		 152 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1346  gas vesicle protein  35.16 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.58115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1560  gas vesicle protein, putative  37.01 
 
 		 160 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3925  gas vesicle protein, putative  34.92 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2213  hypothetical protein  36.94 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0748  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00110  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.265659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1765 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>