11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4124 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4124  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1748  hypothetical protein  52.86 
 
 
282 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2694  hypothetical protein  53.52 
 
 
304 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2169  hypothetical protein  33.93 
 
 
291 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2044  hypothetical protein  30.41 
 
 
278 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39557  predicted protein  29.89 
 
 
543 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39556  predicted protein  29.71 
 
 
611 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423065  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49802  predicted protein  33.33 
 
 
570 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0238  hypothetical protein  30.43 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48969  predicted protein  29.19 
 
 
470 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.731324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4031  hypothetical protein  30.1 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.739746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>