204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0477 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0477  protein of unknown function UPF0040  100 
 
 
144 aa  293  6e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08770  hypothetical protein  38.85 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000078217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  34.81 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09580  hypothetical protein  31.88 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0607138 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1152  cell division protein MraZ  32.54 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0982  cell division protein MraZ  35.25 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.504694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2104  protein of unknown function UPF0040  30.6 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470462  hitchhiker  0.006956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2018  cell division protein MraZ  31.29 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0769  cell division protein MraZ  32.43 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0735205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0817  hypothetical protein  33.86 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0584  cell division protein MraZ  33.33 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1501  cell division protein MraZ  32.03 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09000  MraZ protein  28.19 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0475  cell division protein MraZ  30.43 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000349063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0743  cell division protein MraZ  27.27 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.153316  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1210  cell division protein MraZ  30.53 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.192448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1295  MraZ protein  30.47 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1501  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00904866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1794  protein of unknown function UPF0040  34.11 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0666  cell division protein MraZ  30.71 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13690  cell division protein MraZ  29.85 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1237  cell division protein MraZ  28.12 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1262  cell division protein MraZ  28.12 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  30.71 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  26.77 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  30.71 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1573  MraZ protein  29.13 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0110  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1045  MraZ protein  25.78 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3934  MraZ protein  30.89 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0143451  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2861  cell division protein MraZ  29.55 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0863  MraZ protein  32.59 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16650  mraZ protein  27.41 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.103702  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4072  cell division protein MraZ  29.37 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  29.85 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1398  MraZ protein  27.21 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816682  normal  0.0107217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  30.53 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2278  cell division protein MraZ  29.32 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2979  cell division protein MraZ  31.3 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182358  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3507  cell division protein MraZ  29.85 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1445  MraZ protein  31.25 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0153914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3778  MraZ protein  27.78 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12196  cell division protein MraZ  31.25 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.435477  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0760  cell division protein MraZ  29.66 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl395  cell division protein MraZ  25.85 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000155382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1197  cell division protein MraZ  25.58 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000030245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2419  MraZ protein  29.69 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.0439129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13160  cell division protein MraZ  28.26 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1275  MraZ protein  28.36 
 
 
155 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185799  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0387  cell division protein MraZ  32.28 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0668298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3221  cell division protein MraZ  30.28 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  30.37 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1562  cell division protein MraZ  26.12 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  31.58 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0834  cell division protein MraZ  28.91 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.54539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3636  cell division protein MraZ  28.24 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0349  cell division protein MraZ  29.08 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  28.26 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  28.26 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  28.26 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2733  cell division protein MraZ  26.62 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3098  cell division protein MraZ  26.62 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3208  cell division protein MraZ  28.91 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000170601  normal  0.0171903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0521  cell division protein MraZ  27.48 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0068  cell division protein MraZ  27.48 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0550  cell division protein MraZ  27.48 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3462  MraZ protein  27.21 
 
 
150 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1328  cell division protein MraZ  28.46 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293135  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2853  cell division protein MraZ  27.34 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0172  hypothetical protein  30.3 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3137  cell division protein MraZ  27.7 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52054  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2014  cell division protein MraZ  26.9 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3528  cell division protein MraZ  30.87 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57460  cell division protein MraZ  28.26 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2935  MraZ protein  26.87 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000665289  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0887  MraZ protein  28.35 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1561  cell division protein MraZ  25.37 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  26.75 
 
 
151 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  26.75 
 
 
151 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3520  MraZ protein  25.38 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3447  cell division protein MraZ  29.58 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0414868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4682  cell division protein MraZ  27.54 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3265  cell division protein MraZ  29.13 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3327  cell division protein MraZ  29.13 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3276  cell division protein MraZ  29.13 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1587  MraZ protein  28.12 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2845  cell division protein MraZ  27.91 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373561  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  28.57 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  28.57 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3436  cell division protein MraZ  29.77 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2988  cell division protein MraZ  29.46 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3026  MraZ protein  28.8 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.20935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2662  MraZ protein  27.46 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22890  mraZ protein  28.95 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544234  normal  0.034348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4993  cell division protein MraZ  28.46 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2560  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1109  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0454  cell division protein MraZ  27.13 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.649318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0479  cell division protein MraZ  27.13 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3532  cell division protein MraZ  29.01 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0208024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>