15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1545 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1545  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  287  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4859  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0030  hypothetical protein  36.73 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0009915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2670  hypothetical protein  34.07 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3406  hypothetical protein  36.43 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.088812  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0508  hypothetical protein  36.62 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3347  hypothetical protein  31.01 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184685  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0587  hypothetical protein  31.17 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3243  hypothetical protein  30.43 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00128168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0286  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0286  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1460  hypothetical protein  38.58 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.355787  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4136  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0144  hypothetical protein  27.21 
 
 
150 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33921  predicted protein  23.84 
 
 
251 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>