20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0489 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0174108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  25.87 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  23.6 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  25.17 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  27.41 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  27.33 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  23.78 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  26.42 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  25.42 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  24.05 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  39.62 
 
 		 230 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  24.82 
 
 		 235 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>