14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0030 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0030  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  274  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2422  hypothetical protein  45 
 
 
116 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0673  hypothetical protein  40.77 
 
 
126 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0587085  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3703  hypothetical protein  42.55 
 
 
233 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.194118 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0079  hypothetical protein  40.21 
 
 
322 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0291  hypothetical protein  40.21 
 
 
202 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0068  hypothetical protein  38.24 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3490  hypothetical protein  39 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1818  hypothetical protein  39 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0080  hypothetical protein  39 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2735  hypothetical protein  39 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1040  hypothetical protein  31.75 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00157961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1502  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0799989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0298  hypothetical protein  39.66 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.605616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>