20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18851 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18851  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  100 
 
 
167 aa  340  7e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.801605  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1768  hypothetical protein  96.99 
 
 
166 aa  331  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  97.59 
 
 
180 aa  330  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  82.72 
 
 
206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18031  hypothetical protein  58.28 
 
 
158 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1275  hypothetical protein  58.86 
 
 
195 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21461  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  58.86 
 
 
195 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.901505 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2199  hypothetical protein  52.5 
 
 
193 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2547  hypothetical protein  52.5 
 
 
178 aa  183  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44205  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29001  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  53.8 
 
 
178 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  45.39 
 
 
201 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  44.08 
 
 
209 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1289  protein of unknown function DUF564  45.39 
 
 
201 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3700  hypothetical protein  43.67 
 
 
208 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1318  protein of unknown function DUF564  45.39 
 
 
201 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.542836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0091  hypothetical protein  41.56 
 
 
203 aa  137  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  40.79 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  42.76 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40512  predicted protein  33.33 
 
 
247 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143687  normal  0.760886 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35045  predicted protein  32.76 
 
 
214 aa  84.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132422  normal  0.23655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>