21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Cys-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  92.59 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  85.94 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0003  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0065  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  86.15 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>