61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0576 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0576  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  96.43 
 
 
347 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  62.5 
 
 
601 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  47.37 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  50 
 
 
185 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  46.43 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  47.62 
 
 
197 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  43.86 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  44.64 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  45.61 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  46.81 
 
 
188 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  43.86 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  43.86 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  43.86 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  43.86 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  42.86 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  47.92 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  44.23 
 
 
347 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  43.4 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  52.27 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  46.15 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  43.4 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  37.74 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  47.92 
 
 
192 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  46.94 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  47.73 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  45.28 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  48 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  48 
 
 
176 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  43.18 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4151  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105672  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  48.84 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.09 
 
 
402 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  38.71 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  40 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  38.46 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  45.45 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  37.74 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  40.91 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  40.91 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  46.67 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  46.67 
 
 
169 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  44.44 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  44.44 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  42.55 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  38.3 
 
 
220 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  41.67 
 
 
375 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  42.22 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  42.22 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  42.22 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  47.92 
 
 
175 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  44.44 
 
 
172 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  42.22 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.491637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>