32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3713 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  67 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  51.19 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  51.19 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  43.04 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  44.59 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  37.21 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  32.97 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  36.84 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  42.17 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  34.07 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  32.97 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  36.27 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  38.3 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  32.89 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  36.71 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  36.73 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  32.65 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  37.36 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  35.44 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  35.44 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  36.49 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  34.18 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  34.18 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  35.06 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>