15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2935 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2935  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1240  hypothetical protein  97.78 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2202  hypothetical protein  29.22 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.773621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1256  hypothetical protein  29.55 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1287  hypothetical protein  25.81 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1019  hypothetical protein  25.35 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  27.23 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0815  putative bacteriophage protein  25.71 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.760606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3649  hypothetical protein  25.61 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2247  hypothetical protein  26.05 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.425538 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2926  hypothetical protein  22.87 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1174  putative bacteriophage protein  30.16 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.552425  normal  0.0203947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3498  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131398  normal  0.0583742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1806  putative bacteriophage protein  28.87 
 
 
229 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955973  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2408  putative bacteriophage protein  26.7 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>