15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1240 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2935  hypothetical protein  97.78 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2202  hypothetical protein  29.68 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.773621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1256  hypothetical protein  31.06 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1287  hypothetical protein  26.58 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1019  hypothetical protein  26.13 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3649  hypothetical protein  26.99 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  27.66 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0815  putative bacteriophage protein  25.58 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.760606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2247  hypothetical protein  25.58 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.425538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1174  putative bacteriophage protein  31.15 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.552425  normal  0.0203947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2926  hypothetical protein  22.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3498  hypothetical protein  24.15 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131398  normal  0.0583742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1806  putative bacteriophage protein  27.84 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  32.65 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>