31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2286 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2286    100 
 
 		 1575 bp  3122    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.204488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  80.75 
 
 		 1554 bp  581  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  81.75 
 
 		 1557 bp  531  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  80.27 
 
 		 1563 bp  464  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0834    81.57 
 
 		 1511 bp  337  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  79.42 
 
 		 1557 bp  309  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  81.7 
 
 		 1695 bp  81.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  81.62 
 
 		 1614 bp  71.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  89.66 
 
 		 1713 bp  67.9  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  93.33 
 
 		 1623 bp  65.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  90.2 
 
 		 1731 bp  61.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  97.14 
 
 		 1632 bp  61.9  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  90.2 
 
 		 1536 bp  61.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1385    90 
 
 		 1583 bp  60  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  94.59 
 
 		 1617 bp  58  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  88.68 
 
 		 1578 bp  58  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  83.95 
 
 		 1545 bp  58  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  88.68 
 
 		 1578 bp  58  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  83.75 
 
 		 1587 bp  56  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  89.58 
 
 		 1623 bp  56  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  90.91 
 
 		 1560 bp  56  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  82.11 
 
 		 1710 bp  54  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  92.11 
 
 		 1599 bp  52  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  93.94 
 
 		 1572 bp  50.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  84.62 
 
 		 2550 bp  50.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  80.39 
 
 		 1626 bp  50.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  85.25 
 
 		 1497 bp  50.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  88.89 
 
 		 1647 bp  50.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0707  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 528 bp  48.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  82.5 
 
 		 1512 bp  48.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  88.64 
 
 		 1590 bp  48.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>