12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2142 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  78.02 
 
 
97 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  57.3 
 
 
95 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  48.86 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  42.11 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  38.67 
 
 
181 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  35 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
594 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  37.33 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  32.97 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  35.06 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>