15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0907 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1389    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4443  hypothetical protein  37.48 
 
 		 672 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2303  hypothetical protein  35.13 
 
 		 709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0310  hypothetical protein  27.35 
 
 		 727 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3003  hypothetical protein  28.66 
 
 		 690 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0639  portal protein  26.05 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.308579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0401  portal protein  25.58 
 
 		 725 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000565323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2355  hypothetical protein  24.57 
 
 		 779 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512259  unclonable  0.0000000418473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1462  putative phage portal protein  22.9 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.584586  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0386  hypothetical protein  21.39 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0228  hypothetical protein  21.89 
 
 		 628 aa  67  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00826  hypothetical genomic island protein  26.25 
 
 		 700 aa  54.3  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5695  hypothetical protein  20.3 
 
 		 651 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3518  hypothetical protein  22.18 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.00366785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1145  hypothetical protein  26.54 
 
 		 612 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.983998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>