More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4004 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4004    100 
 
 		 204 bp  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  95.1 
 
 		 255 bp  325  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  94.55 
 
 		 294 bp  313  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4851  transposase IS3/IS911 family protein  93.38 
 
 		 201 bp  214  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  83.15 
 
 		 267 bp  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2475  integrase, catalytic region  85.09 
 
 		 183 bp  91.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2485  integrase, catalytic region  85.09 
 
 		 183 bp  91.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.252644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  82.76 
 
 		 267 bp  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  82.76 
 
 		 267 bp  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  82.76 
 
 		 267 bp  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  88.46 
 
 		 267 bp  83.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  88.46 
 
 		 267 bp  83.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  79.9 
 
 		 459 bp  75.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  79.67 
 
 		 267 bp  67.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  84.44 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  84.44 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  79.67 
 
 		 267 bp  67.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  79.67 
 
 		 267 bp  67.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  84.44 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  79.67 
 
 		 267 bp  67.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  84.44 
 
 		 264 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    79.67 
 
 		 1992 bp  67.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00237  transposase  90.57 
 
 		 237 bp  65.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4647  transposase IS3/IS911 family protein  83 
 
 		 264 bp  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  94.87 
 
 		 264 bp  61.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5642    83.72 
 
 		 1121 bp  60  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02779  hypothetical protein  83.33 
 
 		 147 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  83.33 
 
 		 393 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03722  hypothetical protein  83.33 
 
 		 147 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5637    83.72 
 
 		 1121 bp  60  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02163  hypothetical protein  83.33 
 
 		 147 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 774 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    82.35 
 
 		 257 bp  60  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 264 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  83.33 
 
 		 399 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  83.33 
 
 		 270 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  83.33 
 
 		 450 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02653    83.33 
 
 		 204 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3393    87.1 
 
 		 304 bp  60  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  83.33 
 
 		 399 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05698  IS66 family element, Orf1 protein  83.33 
 
 		 204 bp  60  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0455822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  86.15 
 
 		 267 bp  58  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    88.68 
 
 		 1092 bp  58  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  86.15 
 
 		 267 bp  58  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2658  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  89.36 
 
 		 312 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.568298  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0267  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  89.36 
 
 		 312 bp  54  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0635355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  83.13 
 
 		 264 bp  54  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0870  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00673205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1024  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1055  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  94.12 
 
 		 306 bp  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  94.12 
 
 		 306 bp  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1720  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0359558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  94.12 
 
 		 306 bp  52  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0042  transposase subfamily protein  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0124  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00485388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0194  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.455443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0465  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0490  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1735  transposase subfamily protein  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1745  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0153  transposase subfamily protein  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.529754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0544  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0564  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0579  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000590695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0618  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0686  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0710  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0822  transposase subfamily protein  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0939  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0961  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.231631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0983  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.51087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1000  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1195  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0210238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1268  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.075191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1322  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1380  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3264  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3299  transposase subfamily protein  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561119  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0022  transposase  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0027  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0067  transposase  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693308  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0160  transposase  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0182  IS407A, transposase OrfA  82.56 
 
 		 264 bp  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.237707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>