20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3974 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3974  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890346  normal  0.211994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3129  hypothetical protein  85.93 
 
 		 135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4593  hypothetical protein  83.7 
 
 		 135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434724  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4219  hypothetical protein  75.74 
 
 		 135 aa  207  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.860322  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4831  hypothetical protein  89.81 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4110  hypothetical protein  69.72 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3811  hypothetical protein  64.81 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9867  hypothetical protein  58.2 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4357  hypothetical protein  51.88 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513388  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1852  hypothetical protein  52.24 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4659  hypothetical protein  57.48 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0059  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1101  hypothetical protein  53.51 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3641  hypothetical protein  51.96 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3428  hypothetical protein  52.94 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2739  hypothetical protein  52.21 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1021  hypothetical protein  54.29 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1605  putative exported protein of unknown function  52.94 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2565  hypothetical protein  51.89 
 
 		 182 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.339872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>