44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2946 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  53.3 
 
 
941 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  56.75 
 
 
940 aa  944    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  42.81 
 
 
948 aa  721    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  45.1 
 
 
937 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  42.77 
 
 
957 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  46.76 
 
 
939 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  100 
 
 
943 aa  1810    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  51.46 
 
 
945 aa  770    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  51.45 
 
 
939 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  55.22 
 
 
937 aa  862    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  48.95 
 
 
939 aa  834    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  50.47 
 
 
943 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  57.44 
 
 
941 aa  938    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  44.01 
 
 
937 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  50.8 
 
 
945 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  53.04 
 
 
939 aa  804    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  44.99 
 
 
942 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  44.01 
 
 
937 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  43.08 
 
 
949 aa  724    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  56.18 
 
 
941 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  56.4 
 
 
958 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  55.66 
 
 
941 aa  947    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  56.38 
 
 
938 aa  913    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  46.19 
 
 
942 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  35.44 
 
 
932 aa  544  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  40.66 
 
 
914 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  41.3 
 
 
921 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  41.64 
 
 
925 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  41.89 
 
 
925 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  38.41 
 
 
929 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  39.19 
 
 
927 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  36.58 
 
 
940 aa  419  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  36.13 
 
 
892 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  38.11 
 
 
919 aa  323  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  38.74 
 
 
924 aa  287  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  37.91 
 
 
639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  49 
 
 
279 aa  219  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  36.45 
 
 
259 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  36.77 
 
 
255 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  36.92 
 
 
256 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  35.55 
 
 
256 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  31.25 
 
 
280 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.54 
 
 
316 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  28.98 
 
 
710 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>