21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2562 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  274  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  54.48 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  56.49 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  50.75 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  51.91 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  52.31 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  48.85 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  47.33 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  42.75 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  41.04 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  41.22 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  33.59 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  37.98 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  29.77 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  32.24 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  29.61 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2539  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00977355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>