42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2547 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  214  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  58.89 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  62.96 
 
 
88 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  60.49 
 
 
92 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  59.26 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  60.47 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  62.96 
 
 
86 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  50.47 
 
 
109 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  50.51 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  54.74 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  59.26 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  57.14 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  56.79 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  50.98 
 
 
91 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  53.76 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  49.49 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  51.96 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  56.79 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  52.69 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  54.32 
 
 
106 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  54.32 
 
 
106 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  56.76 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  51.55 
 
 
102 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  57.89 
 
 
88 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  55.84 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  55.84 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  55.84 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  51.95 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  53.95 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  52.63 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  44.59 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  40.59 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  48.61 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  48.24 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  51.95 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  43.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  44.87 
 
 
83 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  34.74 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47800  hypothetical protein  39.44 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0117434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  33.73 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>