24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0588 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0588  membrane protein-like protein  100 
 
 		 67 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  68.66 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  65.67 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  65.67 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  59.7 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  57.81 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  46.03 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  47.76 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  46.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  46.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  46.77 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  48.39 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  46.3 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  44.62 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  44.62 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  48.15 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  38.6 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  39.22 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  32.31 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  45.1 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>