14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5905 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5905  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6150  metallophosphoesterase  62.26 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0823  metallophosphoesterase  62.86 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1718  metallophosphoesterase  45.37 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0362853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0086  hypothetical protein  40.68 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00135012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  43.33 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3343  metallophosphoesterase  40.52 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1333  metallophosphoesterase  47.17 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2548  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1695  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3045  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1675  hypothetical protein  39.56 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3062  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2256  metallophosphoesterase  31.88 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  hitchhiker  0.0021497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>