10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2548 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013224  Dret_2548  metallophosphoesterase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
287 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1333  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6150  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1718  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0362853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0823  metallophosphoesterase  29.23 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0086  hypothetical protein  27.36 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00135012  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3343  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5905  hypothetical protein  32.73 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3014  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>