9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3614 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3614  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  213  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  64.94 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  49.09 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  50.5 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  54.26 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4231  hypothetical protein  45.9 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  50 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1345  putative lipoprotein  43.01 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  48.53 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>