14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2985 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1024    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  65.84 
 
 		 479 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  47.17 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  34.89 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  26.82 
 
 		 403 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  25.88 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  25.88 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  24.58 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  22.64 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1128  hypothetical protein  23.73 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.541844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1419  hypothetical protein  30.85 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  32.26 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  22.8 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  24.4 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>