22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2164 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2164  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1783  20S proteasome, A and B subunits  64.29 
 
 		 196 aa  270  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188776  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2670  20S proteasome, A and B subunits  63.64 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1602  hypothetical protein  56.7 
 
 		 191 aa  227  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00717688  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1617  20S proteasome A and B subunits  54.64 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00179483  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1945  20S proteasome A and B subunits  54.64 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0193808  hitchhiker  0.000995927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1305  20S proteasome, A and B subunits  53.89 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1198  20S proteasome, A and B subunits  51.02 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000168081  normal  0.567308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1847  hypothetical protein  39.49 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.3 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.42 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  23.78 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  36.62 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  35.94 
 
 		 176 aa  42  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.4 
 
 		 199 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0456  20S proteasome A and B subunits  42.62 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.03 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  47.37 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.18 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  27.1 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.28 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.04 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>