13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2143 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2143  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  536  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003096  hypothetical protein  52.36 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000102817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02750  hypothetical protein  51.57 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0830  hypothetical protein  54.09 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00562618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3933  hypothetical protein  32.64 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0148216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3130  DNA polymerase beta subunit  31.62 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.228068  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46260  hypothetical protein  31.17 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.231061  normal  0.0695784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2709  hypothetical protein  31.49 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2485  nucleotidyltransferase domain protein  21.85 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2350  nucleotidyltransferase domain protein  21.85 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2188  hypothetical protein  19.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3581  DNA polymerase beta domain protein region  26 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0372  hypothetical protein  23.56 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.256043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>