25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1537 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1537  pvcA protein  100 
 
 		 608 aa  1277    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  24.92 
 
 		 587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0229  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  30.08 
 
 		 353 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1924  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2201  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.929811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1225  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0939  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1679  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0228  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0318  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  29.39 
 
 		 352 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02705  conserved hypothetical protein, putative pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein ditA (Eurofung)  25.07 
 
 		 664 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3225  Pyoverdine biosynthesis protein  27.72 
 
 		 321 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0703  pyoverdine biosynthesis protein  26.26 
 
 		 295 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.215316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1103  Pyoverdine biosynthesis protein  27.37 
 
 		 321 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3133  Pyoverdine biosynthesis protein  26.85 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3777  Pyoverdine biosynthesis protein  25.28 
 
 		 274 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0236  hypothetical protein  23.97 
 
 		 349 aa  94.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35430  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  27.05 
 
 		 328 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000151483  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2754  pyoverdine biosynthesis  26.97 
 
 		 322 aa  94  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2987  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  27.05 
 
 		 328 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0236  hypothetical protein  23.34 
 
 		 349 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  20.75 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29841  predicted protein  27.24 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0522184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2986  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  20.3 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35420  pyoverdine biosynthesis protein PvcB  20.51 
 
 		 291 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00595463  normal  0.0278351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>