12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0873 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  709    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  30.6 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  34.4 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  30.91 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  31.76 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  22.96 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1371  hypothetical protein  33.65 
 
 		 263 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  35.06 
 
 		 444 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>