15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4937 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  71.63 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  51.47 
 
 
329 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  36.72 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  36.09 
 
 
413 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  34.38 
 
 
154 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  34.4 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  35.61 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  34.69 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  27.22 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0164  hypothetical protein  35.37 
 
 
936 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00430  hypothetical protein  34.15 
 
 
936 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1371  hypothetical protein  30.97 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  23.58 
 
 
444 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3754  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>