12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3763 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  920    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  45.29 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  29.6 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  27.99 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3857  hypothetical protein  26.41 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  30.63 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0103  hypothetical protein  21.65 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887161  hitchhiker  0.0000190274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  31.78 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  30.3 
 
 		 329 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  35.06 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>