19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1539 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1588  glycosyl transferase group 1  98.36 
 
 
427 aa  845    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1539  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
427 aa  862    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0388449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1701  glycosyl transferase, group 1  49.3 
 
 
431 aa  425  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1717  glycosyl transferase, group 1  47.44 
 
 
433 aa  418  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0697  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
430 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2515  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
425 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  20.09 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.14 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
328 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  24.35 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  25.82 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 
419 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>