19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0980 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  394  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  28.66 
 
 
267 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  30.41 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  30.92 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  26.22 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  28.48 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  26.17 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3682  hypothetical protein  24.64 
 
 
154 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  28.39 
 
 
246 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  26.92 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  24.55 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1056  hypothetical protein  29.17 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0117919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  30.36 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  28.66 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2337  hypothetical protein  20.86 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0218  hypothetical protein  24.67 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.792855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1128  hypothetical protein  25.34 
 
 
145 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2186  hypothetical protein  29.58 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  24.48 
 
 
191 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>