13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0838 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0838  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.707825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1134  protein of unknown function DUF369  58.41 
 
 
124 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1462  hypothetical protein  60.87 
 
 
124 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1416  hypothetical protein  60.87 
 
 
124 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1586  hypothetical protein  48.78 
 
 
123 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000521302  normal  0.608079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3204  hypothetical protein  49.56 
 
 
139 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1228  hypothetical protein  53.49 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1494  hypothetical protein  39.29 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0757  protein of unknown function DUF369  40.54 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1661  protein of unknown function DUF369  36.94 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1835  hypothetical protein  41.03 
 
 
245 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.221842  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0931  hypothetical protein  28.87 
 
 
91 aa  48.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.172428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2611  hypothetical protein  37.97 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>