13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1462 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1462  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  249  9.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1416  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  248  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1134  protein of unknown function DUF369  53.78 
 
 
124 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0838  hypothetical protein  60.87 
 
 
127 aa  110  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.707825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1586  hypothetical protein  43.09 
 
 
123 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000521302  normal  0.608079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3204  hypothetical protein  50.56 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1228  hypothetical protein  41.94 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1494  hypothetical protein  34.96 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0757  protein of unknown function DUF369  34.31 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1661  protein of unknown function DUF369  30.77 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1835  hypothetical protein  47.17 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.221842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2611  hypothetical protein  32.26 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437606  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0931  hypothetical protein  25.81 
 
 
91 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.172428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>