19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0544 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  100 
 
 		 544 aa  1093    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  24.8 
 
 		 579 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  25.1 
 
 		 535 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  25.39 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  24.15 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  23.63 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  25.34 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  24.94 
 
 		 581 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  25.33 
 
 		 619 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  24.66 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  26.46 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  24.25 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  23.48 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  25.57 
 
 		 618 aa  77  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  24.41 
 
 		 583 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  21.59 
 
 		 589 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  20.69 
 
 		 538 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1233  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000686662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>