12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2954 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1135    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.491927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1541    100 
 
 		 196 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1843    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1946    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2696    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2954    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3458    100 
 
 		 2595 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0212053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3460    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00185656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3878    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4054    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4089    100 
 
 		 193 bp  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  86.49 
 
 		 1014 bp  67.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>