20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2738 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  160  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  51.32 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  51.32 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12366  hypothetical protein  51.39 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  42.11 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  56.1 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  53.85 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  41.82 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  41.51 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  41.46 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  45.28 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  42.31 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  46.51 
 
 		 486 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  51.16 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  44.44 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>