32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1770 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  52.6 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  52.08 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  52.08 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  44.9 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  43.07 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  46.11 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  43.63 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  43.01 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  42.19 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  43.22 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  37.8 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  39.49 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  39.07 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  44.22 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  38.92 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  43.64 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  40.88 
 
 		 238 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.3 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  39.04 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  37.23 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  38.92 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  37.37 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  35.32 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  34.9 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  42.59 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  32.68 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  33.92 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.96 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  33.91 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>