49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1490 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1490  cutinase  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0468617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1283  cutinase  40.2 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00904546  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0988  cutinase  40.4 
 
 
292 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1016  cutinase  40.4 
 
 
292 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1006  cutinase  40.4 
 
 
292 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5074  cutinase  41.26 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3344  cutinase  29.57 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1514  cutinase  31.53 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0692058  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10346  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14420)  33.33 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.0228214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1515  cutinase  27.78 
 
 
514 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0339808  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4432  cutinase  30 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3177  cutinase  31.36 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4311  Cutinase  28.17 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4965  cutinase  27.48 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0427886  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0371  cutinase  30.4 
 
 
244 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.656734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1939  cutinase  28.83 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231971  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3117  cutinase  32.99 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1893  cutinase  28.83 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3552  cutinase  30.32 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3105  cutinase  29.21 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12324  cutinase cut2  26.46 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12015  cutinase precursor cfp21  25.91 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4967  cutinase  24.29 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0510354  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5679  cutinase  26.51 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5389  cutinase  28.77 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5300  cutinase  28.77 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0499179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5603  cutinase  29.53 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00618421  normal  0.511306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5311  cutinase  28.8 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5223  cutinase  28.8 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13488  cutinase precursor cut3  27.23 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.957767  normal  0.0619563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4439  cutinase  27.84 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13489  cutinase precursor cut4  27.41 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0687633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1873  cutinase  28.38 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0829992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3373  cutinase  30.73 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201335  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  32.9 
 
 
818 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1116  cutinase  26.67 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.782671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1133  cutinase  26.67 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1145  cutinase  26.67 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.713358  normal  0.552201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1440  cutinase  30.65 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  29.73 
 
 
334 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1924  cutinase  28.28 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4300  cutinase  25.77 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05309  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09380)  30.52 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  32.77 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  29.82 
 
 
457 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1439  cutinase  23.78 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91831  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  29.82 
 
 
457 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4966  cutinase  32.54 
 
 
205 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0417178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1441  cutinase  27.23 
 
 
221 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>