23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0988 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0988  cutinase  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1006  cutinase  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1016  cutinase  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1283  cutinase  72.88 
 
 
280 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00904546  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5074  cutinase  69.92 
 
 
263 aa  345  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1490  cutinase  39.52 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0468617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17200  Cutinase  24.91 
 
 
423 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4966  cutinase  29.33 
 
 
205 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0417178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0371  cutinase  33.57 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.656734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5793  cutinase  37.14 
 
 
233 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1440  cutinase  28.83 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4432  cutinase  27.27 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  31.14 
 
 
818 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1514  cutinase  26.84 
 
 
235 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0692058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5603  cutinase  32.09 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00618421  normal  0.511306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5311  cutinase  32.58 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5223  cutinase  32.58 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10346  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14420)  32.06 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.0228214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3177  cutinase  29.6 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3373  cutinase  34.64 
 
 
221 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201335  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1924  cutinase  27.62 
 
 
223 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4311  Cutinase  26.5 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4300  cutinase  30.63 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>