17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1444 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1444  acyltransferase 3  100 
 
 
460 aa  926    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1319  hypothetical protein  53.38 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  34.46 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0774  hypothetical protein  28.78 
 
 
468 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1615  acyltransferase 3  29.22 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0727  hypothetical protein  26.1 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0865  acyltransferase 3  27.75 
 
 
442 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2451  acyltransferase 3  26.65 
 
 
395 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1149  acyltransferase  24.62 
 
 
380 aa  90.5  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.385037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1364  acyltransferase  23.48 
 
 
386 aa  90.5  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.510476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  30.96 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1010  acyltransferase 3  28.49 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.114811  hitchhiker  0.00000776761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0863  acyltransferase  25.58 
 
 
166 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  27.23 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  24.08 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  25.59 
 
 
375 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>