17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0170 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0171  cutinase precursor  62.88 
 
 		 313 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  47.33 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  45.3 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  45.3 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  45.3 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  44.78 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  44.52 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  45.62 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  35.61 
 
 		 457 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  35.61 
 
 		 457 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  31.48 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4874  hypothetical protein  27.84 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1763  hypothetical protein  31.01 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1490  cutinase  29.58 
 
 		 244 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0468617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  26.4 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32950  PE-PPE domain-containing protein  31.47 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>