18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1950 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  67.54 
 
 
536 aa  759    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  63.81 
 
 
535 aa  680    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  61.94 
 
 
536 aa  649    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1053    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  28.07 
 
 
589 aa  140  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  29.08 
 
 
579 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  25.54 
 
 
544 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  31.21 
 
 
619 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  22.92 
 
 
581 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  27.24 
 
 
578 aa  73.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  26.11 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
576 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  25.37 
 
 
580 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  26.57 
 
 
618 aa  70.1  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  22.82 
 
 
566 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  26.49 
 
 
583 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  21.59 
 
 
538 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  24.12 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>